Сингер М., Берг П. «Гены и геномы. Том 2» 1998 год

Сингер М., Берг П. - Гены и геномы. Том 2 - 1998 год

Автор: Сингер М., Берг П.

Год: 1998

Университетское руководство по молекулярной биологии, написанное выдающимися американскими учеными, членами Национальной академии наук (П. Берг - лауреат Нобелевской премии). Книгу отличают общебиологический подход, глубина теоретических обобщений, изящная и наглядная форма подачи материала.
Во 2 томе рассматриваются следующие вопросы: структура и экспрессия генов эукариот, молекулярная структура геномов эукариот, геномные перестройки с участием разнообразных мобильных элементов, происходящие запрограммированным и случайным образом.
Для молекулярных биологов, преподавателей и студентов университетов, специалистов.

Часть III. Молекулярная организация, экспрессия и регуляция эукариотических генов

Введение
Структура эукариотических генов и их экспрессия
Прерывистые гены
Регуляция экспрессии генов у эукариот
Строение генома эукариот
Хромосомные карты
Размеры эукариотических геномов
Связь между специфическими последовательностями ДНК и морфологией хромосомы
Перестройки последовательностей ДНК
Случайные перестройки генома
Программируемые перестройки
Эволюционные аспекты
Сравнительная молекулярная генетика
Эволюционная история генов
Происхождение генетических систем
Заключение

Глава 8. Структура и регулируемая экспрессия эукариотических генов
8.1. Сравнение структурных особенностей прокариотических и эукариотических генов
а. Прокариотические гены
б. Эукариотические гены
8.2. Строение генов класса I и их экспрессия
а. Единицы транскрипции
б. Аппарат транскрипции
в. Области регуляции транскрипции рДНК
г. Терминация транскрипции рДНК
д. Сопряжение терминации и инициации транскрипции
8.3. Строение и экспрессия генов класса II
а. Общие положения
б. Аппарат транскрипции
в Созревание мРНК и U-PHK
г. Регулируемая экспрессия вирусных генов
д. Регуляция генов, специфичная в отношении типа клеток и стадии развития
е. Индукция и репрессия транскрипции
ж. Транскрипционная регуляция морфогенеза
з. Регуляция транскрипции генов U-PHK
8.4. Структура и, экспрессия генов класса III
а. Основные свойства
б. Последовательности, регулирующие инициацию транскрипции
в. Влияние факторов транскрипции на инициацию транскрипции с участием РНК-полимеразы III
г. Терминация транскрипции с участием РНК-полимеразы III
д. Регуляция экспрессии генов 5S-pPHK в процессе развития организма
8.5. Интроны
а. Частота встречаемости интронов
б. Различные виды интронов
в. Интроны, вырезаемые при помощи автокаталитического сплайсинга
г. Сплайсинг ядерной про-мРНК
д. Сплайсинг тРНК
е. Альтернативный сплайсинг: множественные белки одного гена
8.6. Новые структурные элементы в факторах транскрипции
а. Домены связывания ДНК
б. Домены регуляции транскрипции
8.7. Глобальные механизмы регуляции экспрессии генов
а. Упаковка ДНК
б. Топология и конформация ДНК
в. Метилирование ДНК
г. Регулируемая утилизация мРНК

Глава 9. Молекулярная структура геномов эукариот
9.1. Архитектурные элементы
а. Классификация сегментов ДНК
б. Повторяемость последовательностей ДНК
в. Эволюционный аспект повторяемости последовательностей
9.2. Гены, кодирующие РНК
а. Гены 18S-, 5, 8S- и 28S-pPHK
б. Гены 5S-pPHK
в. Сцепление всех четырех генов рРНК у дрожжей
г. Гены, кодирующие тРНК
д. Гены малых ядерных и цитоплазматических РНК
9.3. Гены, кодирующие белки
а. Некоторые общие замечания
б. Примеры мультигенных семейств
в. Гистоновые гены: консервативность кодирующих последовательностей и различия в организации
9.4. Тандемные повторы: характерная особенность всех эукариотических геномов
а. Гены, состоящие из тандемных повторов сегментов ДНК
б. Тандемные повторы вне кодирующих областей
в. Тандемные повторы в области центромер и теломер
г. Возможные функции тандемных повторов
д. Механизмы образования и эволюции тандемных повторов
9.5. Повторяющиеся последовательности, рассеянные по всему геному
а. Характер распределения повторов
б. Диспергированные повторы у беспозвоночных
в. Многочисленные семейства диспергированных повторов в геномах млекопитающих
г. Функции диспергированных повторов
д. Замечательное единообразие диспергированных повторяющихся последовательностей
9.6. Последовательности в области центромер и теломер
а. Последовательности в области центромер
б. Последовательности в области теломер
в. Искусственные хромосомы дрожжей
9.7. Геномы органелл эукариот: ДНК митохондрий и хлоропластов
а. Геномы митохондрий
б. Необычная митохондриальная ДНК трипаносом
в. ДНК хлоропластов
г. Происхождение ДНК органелл

Глава 10. Реорганизация генома
10.1. Общие свойства незапрограммированных транспозиций
а. Различные типы мобильных элементов
б. Дупликапия сайтов-мишеней
в. Мобильные элементы как диспергированные повторяющиеся последовательности
10.2. Транспозирующиеся элементы
а. Транспозирующиеся элементы прокариот
б. Р-элементы дрозофилы
в. Контролирующие элементы у кукурузы
10.3. Ретротранспозоны
а. Общие свойства ретротранспозонов класса I
б. Ту-элементы дрожжей
в. Copia-подобные элементы дрозофилы
г. IAP-последовательности у мышей
д. Сравнение с ретровирусами
е. Ретротранспозоны класса II
10.4. Ретрогены
а. Процессированные псевдогены полипептидов
б. Процессированные псевдогены РНК
10.5. Другие необычные мобильные элементы
а. Fold-back-элементы дрозофилы
б. Вставки в рДНК Drosophila
10.6. Запрограммированные перестройки и модуляция экспрессии генов
а. Прокариотические модели-транслокация путем флип-флоп-инверсий
б. Типы спаривания у дрожжей - кассетный механизм
в. Гены, кодирующие иммунные белки позвоночных
г. Вариабельные поверхностные антигены трипаносомы
10.7. Запрограммированные амплификация и модуляция экспрессии генов
а. Непропорциональная репликация: хорионические гены дрозофилы
б. рДНК Xenopus: амплификация по типу катящегося кольца
в. Амплификация рДНК Tetrahymena в макронуклеусах
10.8. Незапрограммированные тандемные амплификации
а. Амплификации, позволяющие компенсировать ферментную недостаточность
б. Структура амплифицированных генов
в. Механизм амплификации

Литература


Часть IV. Исследование биологических систем и манипуляции с ними

Исследование сложных биологических систем
Семейство генов зрительных пигментов
Согласованные взаимодействия между продуктами разных генов
Жизненный цикл вирусов
Картирование геномов
Физическая и генетическая карты
Картирование больших геномов
Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов
Дифференциальная экспрессия генов в специфических клетках и тканях
Специфическая экспрессия генов в поджелудочной железе
Посттрансляционные изменения как регуляторы направленного потока генных продуктов
Регуляция генной экспрессии путем перестроек последовательности ДНК
Изменение биологических систем
Синтез нормальных и модифицированных эукариотических белков
Генетическая инженерия
Изменение соматических клеток
Изменение клеток зародышевой линии
Новые направления
Эмбриональное развитие и дифференцировка у многоклеточных организмов
Инсерционный мутагенез
Специфическая и случайная модификация генома млекопитающих
Перспективы
Будущие заботы

Литература

Предметный указатель
Указатель латинских названий