Николайчик Е.А. «Регуляция метаболизма. Курс лекций» 2002 год

Николайчик Е.А. - Регуляция метаболизма. Курс лекций - 2002 год

Автор: Николайчик Е.А.

Год: 2002

Курс лекций по генетике, относящихся к регуляции метаболизма в ДНК. Снабжено множеством иллюстраций.


1. ОСНОВНЫЕ ПРИНЦИПЫ РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ. РЕГУЛЯЦИЯ НА УРОВНЕ ТРАНСКРИПЦИИ
1.1 ОПЕРОННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОВ
lac оперон
1.2 КАК РАБОТАЮТ РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ?
Связывание регуляторных белков с ДНК
1.3 ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ РЕГУЛЯТОРНЫХ БЕЛКОВ С РНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ
1.4 АРАБИНОЗНЫЙ ОПЕРОН
1.5 ТРИПТОФАНОВЫЙ ОПЕРОН
Аттенуация
1.6 РЕГУЛЯЦИЯ НА СТАДИИ ТЕРМИНАЦИИ. АНТИТЕРМИНАЦИЯ

2. ФОСФОТРАНСФЕРАЗНАЯ СИСТЕМА
Катаболитная репрессия
bgl оперон – ФТС и антитерминация

3. АЛЬТЕРНАТИВНЫЕ СИГМА-ФАКТОРЫ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
σ-факторы бактериофагов. Каскадная регуляция экспрессии генов
rpoS
rpoE

4. ТЕПЛОВОЙ ШОК, ФОЛДИНГ И ДЕГРАДАЦИЯ БЕЛКОВ
Молекулярные шапероны
АТФ-зависимые протеазы

5. ХОЛОДОВОЙ ШОК

6. СЕНСОРНЫЕ СИСТЕМЫ
ДВУХКОМПОНЕНТНЫЕ СИСТЕМЫ
СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ ГИСТИДИНОВЫХ ПРОТЕИНКИНАЗ
Каталитическое киназное ядро
HPt-домены
Сенсорный домен
Линкерный домен
СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ РЕГУЛЯТОРОВ ОТВЕТА
Активности и структура
Регуляторный домен
Эффекторный домен
АКТИВАЦИЯ ФОСФОРИЛИРОВАНИЕМ
АРХИТЕКТУРА РЕГУЛЯТОРНЫХ СИСТЕМ
Фосфотрансляционные системы
РЕГУЛЯТОРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ
Регуляция активности ГК
Регуляция дефосфорилирования РО
Другие способы регуляции

7. ХЕМОТАКСИС
7.1 УСТРОЙСТВО И ПРИНЦИП ДЕЙСТВИЯ ДВИГАТЕЛЬНОГО АППАРАТА БАКТЕРИЙ
Регуляция синтеза жгутикового аппарата
7.2 ЧТО ТАКОЕ ХЕМОТАКСИС И КАК ОН РЕАЛИЗОВАН У БАКТЕРИЙ?
7.3 БЕЛКОВЫЙ АППАРАТ ХЕМОТАКСИСА
Рецепторы хемотаксиса
Как внеклеточный стимул транслируется во внутриклеточный сигнал?
Цитоплазматические сигнальные белки и регуляторный механизм хемотаксиса
Метилазы хемотаксиса и сенсорная адаптация

8. УТИЛИЗАЦИЯ АЗОТА

9. КИСЛОРОДНЫЙ СТРЕСС И РЕДОКС КОНТРОЛЬ
АКТИВНЫЕ РАДИКАЛЫ: ИХ ПОВРЕЖДАЮЩЕЕ ДЕЙСТВИЕ И МЕХАНИЗМ ИНАКТИВАЦИИ
Причина окислительного стресса
Механизмы окислительных повреждений клетки
ЗАЩИТА ОТ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО СТРЕССА
SoxRS регулон
OxyR регулон
АДАПТАЦИЯ К АНАЭРОБИОЗУ
FNR как сенсор кислорода
ArcB

10. ДЕЛЕНИЕ БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ И ЕГО РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ КЛЕТОЧНОГО ЦИКЛА У CAULOBACTER CRESCENTUS

11. СПОРУЛЯЦИЯ У BACILLUS SUBTILIS
Морфология споруляции
Как принимается решение о начале споруляции?
Роль активаторов транскрипции на разных стадиях споруляции

12. МЕЖКЛЕТОЧНЫЕ КОММУНИКАЦИИ. QUORUM SENSING
Синтез АГСЛ
Регуляция синтеза экзоферментов у Erwinia
Роль АГСЛ-сигналов в экологии бактериальных популяций. Кросс-сигналы (и ингибиров антибиотиками)

13. СЕКРЕЦИЯ БЕЛКОВ
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ ПЕРВОГО ТИПА
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ ВТОРОГО ТИПА (GSP)
Sec система
Основная терминальная ветвь GSP
Регуляция GSP
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ III ТИПА
1.1.Специфика аппарата секреции III типа и его компоненты
1.2. Субстраты аппарата секреции III типа
1.3. Организация и регуляция генов, кодирующих белки аппарата секреции III типа
Секреторные шапероны
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ IV ТИПА

14. СТРОГИЙ ОТВЕТ

15. SOS ОТВЕТ
SOS-мутагенез
16. РЕГУЛЯЦИЯ СТАБИЛЬНОСТИ МРНК
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ РНКАЗЫ, УЧАСТВУЮЩИЕ В ДЕГРАДАЦИИ мРНК
РНКаза Е
РНКаза III
Полинуклеотидфосфорилаза
РНКаза II
Мультибелковые комплексы деградации РНК
РНК-хеликазы в деградации РНК
Полиаденилирование оказывает противоположный эффект на стабильность бактериальных и эукариотических мРНК